2008年购买底商，2010年签订正式购房合同，2022年才给办理房本

针对您提到的房地产公司可能提出异议导致冻结资金未能全部执行的情况，根据仲裁裁决和法院强制执行的相关规定（《中华人民共和国民事诉讼法》第二百四十三条等），您已胜诉并申请强制执行，法院应依法执行。若房地产公司提出异议，法院会进行审查。此时，您应积极配合法院提供必要证据，如购房合同、仲裁裁决书等，以证明房地产公司确应退还多收房款。同时，关注法院审查进展，必要时可寻求专业律师协助，确保执行程序顺利进行。
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若房地产公司还有其他财产，您确实可以考虑申请冻结其更多财产以确保执行。具体操作包括：1. 向法院提交书面申请，说明房地产公司仍有其他可供执行的财产；2. 提供相关财产线索，如房产、车辆、银行存款等；3. 法院会根据您提供的线索和实际情况，决定是否采取进一步的冻结措施。
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从法律角度，确保仲裁裁决和强制执行的有效性，您应：1. 保留好所有与购房相关的证据材料，如合同、收据、仲裁裁决书等；2. 密切关注法院执行进展，及时与执行法官沟通；3. 若遇到阻碍，如房地产公司提出无理异议，及时寻求专业律师协助，通过法律途径维护自身权益；4. 遵守法院裁定，积极配合执行程序。